Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB1P08238 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms