Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms