Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRMUO75648 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRMUO75648 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms