Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms