Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAK2O60296 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAK2O60296 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms