Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LDB2O43679 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDB2O43679 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LDB2O43679 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LDB2O43679 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms