Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF13O43567 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF13O43567 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF13O43567 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms