Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms