Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms