Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DXG7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DXG7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DXG7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms