Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF330Q9Y3S2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms