Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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HCN4Q9Y3Q4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN4Q9Y3Q4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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