Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms