Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms