Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms