Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK1Q9UPV9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms