Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD4AQ9UPU9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms