Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF3Q9ULT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms