Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRPF3Q9ULD4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms