Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB23Q9ULC3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms