Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PHF11Q9UIL8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms