Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA3Q9UI47 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms