Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFDP1Q9UEE9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms