Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MBD5Q9P267 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms