Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms