Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HACD3Q9P035 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms