Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms