Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CWC25Q9NXE8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms