Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PNPLA3Q9NST1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms