Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms