Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms