Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms