Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMG20AQ9NP66 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20AQ9NP66 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms