Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPJQ9HC77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms