Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC52A2Q9HAB3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms