Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms