Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms