Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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