Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms