Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAGR1Q9BTK6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms