Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms