Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms