Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A9Q96Q91 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms