Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB3A2Q96PL1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms