Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms