Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms