Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH8Q96L42 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH8Q96L42 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms