Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED3Q96IU2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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