Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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RNF185Q96GF1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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