Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STAMBPL1Q96FJ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms